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Las exportaciones de salmónidos del año 2007 superaron los US$2.200 millones y se estima que en el presente año se mantendrá en esta cifra. Sin embargo, para el próximo año se proyecta, que el impacto económico del virus de la Anemia Infecciosa del Salmón (ISA), producirá una baja de un 20-30 % en la producción del salmón (450-660 millones de dolares). Esta constricción en la producción inducirá el despido de al menos 6.000 trabajadores asociados al encadenamiento productivo del cluster del salmón. Se estima que para combatir esta patología y su impacto social y económico en la sustentabilidad de la producción del salmón la industria deberá invertir unos 400 millones de dólares en bioseguridad. El virus ISA (ISAV) posee un genoma de RNA de cadena simple y polaridad negativa compuesta 8 segmentos, de un tamaño variable entre 1 a 2.4 kb, con un tamaño molecular total de 14.3 kb. Para la detección molecular de ISAV los sistemas de vigilancia utilizan kits diagnósticos basados en secuencias del genoma viral. Sin embargo una de las características más negativas de este virus es que tiene la habilidad de generar una alta tasa de mutación, re-arreglos y recombinación cambiando su material genético rápidamente y por consecuencia cambia sus proteínas modificando la antigenicidad de éstas. Esta variabilidad genómica y proteómica genera la posibilidad que en su diagnostico molecular se produzcan falsos negativos. Por ello, en este proyecto se desarrollara un análisis genómico y proteómico para generar kits de diagnostico molecular de alta certeza y precisión para ISAV. Para abordar esta oportunidad biotecnológica, postulamos utilizar las tecnologías desarrolladas en nuestro laboratorio para realizar una caracterización genómica y proteómica de todas las nuevas variantes de ISAV presentes en Chile. Esto nos permitirá identificar nuevas secuencias de DNA estables de las variantes chilenas, así como identificar y aislar proteínas virales que son vitales para la replicación viral y que presentan el menor grado de mutaciones. El análisis genómico permitirá el re-diseño de partidores de DNA para el desarrollo y producción de nuevos kit de PCR múltiple y PCR cuantitativo, permitiendo por lo tanto el desarrollo de kits diagnósticos más exactos y precisos. El análisis proteómico y la expresión y purificación de proteínas virales estables nos permitirá el desarrollo de anticuerpos y de kit de ELISA de alta certeza y precisión. El proyecto actual proveerá por lo tanto de las herramientas moleculares que sustenten un plan de vigilancia molecular dinámico de largo plazo y de alta bioseguridad. Esta estrategia permitirá mantener y aumentar en forma determinante la competitividad y sustentabilidad de la industria del salmón. |